fix: replace hardcoded ~/.desirecore paths with ${DESIRECORE_ROOT} variable (#16)

## Summary

- 将所有技能文件中的硬编码 `~/.desirecore/` 和 `$HOME/.desirecore/` 路径替换为
`${DESIRECORE_ROOT}/` 变量
- 递增 manifest.json version 至 1.2.1

## Why

dev 模式下 `DESIRECORE_HOME=~/.desirecore-dev`，硬编码路径导致技能读取错误的端口文件和目录。主仓库的
`variable-substitutor.ts` 会在运行时将 `${DESIRECORE_ROOT}` 替换为实际根目录。

## Test plan

- [ ] `npm run dev` 启动后触发任意技能，确认端口路径解析为
`~/.desirecore-dev/agent-service.port`
- [ ] prod 模式确认路径为 `~/.desirecore/agent-service.port`

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skills/update-agent/CHANGELOG.md

@@ -4,7 +4,7 @@
 
 - **Breaking**：从 HTTP API 迁移到 AgentFS 直接文件操作
 - 移除所有 HTTP API 端点引用（PUT persona/principles/files）
-- 变更应用改为直接读写 `~/.desirecore/agents/<agentId>/` 下的文件
+- 变更应用改为直接读写 `${DESIRECORE_ROOT}/agents/<agentId>/` 下的文件
 - 回滚流程改用 git log/show 命令查看历史版本
 - 错误处理改为文件系统错误（文件不存在、权限不足等）